Привет всем! Я ищу биоинформатика / программиста / программиста-математика к себе в коллеги в Лабораторию Сравнительной и Функциональной Геномики в Институт Биоорганической Химии РАН (Москва, м. Беляево) уровня студента-аспиранта. Мы занимаемся:
- системой адаптивного иммунитета человека - изучаем, как изменяется состояние иммунной системы человека при разных заболеваниях, в частности, при аутоиммунных, а также разные фундаментальные вопросы (например, мы можем спасти вас, если ваш злой близнец убил кого-то, обвинили в этом вас, но он оставил немного своей крови на месте преступления. Но можем и не спасти - это же наука);
- ретроэлементами - специальными кусками генома, которые “прыгают” по нему и могут запрыгнуть куда-нибудь не туда;
Все это делается с помощью NGS и рук разной степени специализации. Для обработки мы используем R, Python и C++.
Что можно делать технически: пакеты для анализа данных иммунитета на R / C++, скрипты для обработки NGS данных на Python, софт на C++. Лично я еще думаю про интеграцию Rust в качестве рабочего языка, так что можно будет посмотреть и в эту сторону.
Что можно делать концептуально: разрабатывать эффективные алгоритмы и структуры данных, придумывать методы для статистического анализа, анализировать данные. Есть несколько нереализованных идей про применение машинного обучения, и еще полторы - про стохастическую оптимизацию.
Если вы что-то не умеете (например, не очень знаете статистику или Python), но хотите научиться - смело пишите.
Сначала не за деньги (в будущем это обсуждаемо), а за статьи, опыт и интересные задачи. Можно также любые курсовые / дипломы / аттестационные работы со мной в качестве руководителя / консультанта. Можно (и нужно!) работать удаленно, просто быть в контакте с лабораторией и раз в две недели появляться вживую для обсуждения. И, очевидно, никто от вас не будет требовать восьми часов пять дней в неделю. Всего лишь десять и семь - это же наука.
Если вы решитесь мне написать, то сообщите сразу, пожалуйста, что вы умеете. Если есть какие-либо вопросы - с удовольствием на них отвечу.
И, если не трудно, перепостите, пожалуйста.